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| I | Zamalek | - | Vita Club Mokanda | 1:0 | ||
| V | Vita Club Mokanda | - | Zamalek | 0:0 | ||
| I: 15.03.2013 17:00 | V: 06.04.2013 16:30 | Campeones: Zamalek | ||||
| I | FUS de Rabat | - | Union Sportive Douala | 3:0 | ||
| V | Union Sportive Douala | - | FUS de Rabat | 1:0 | ||
| I: 15.03.2013 17:00 | V: 07.04.2013 15:30 | Campeones: FUS de Rabat | ||||
| I | JSM Béjaïa | - | Asante Kotoko | 0:0 | ||
| V | Asante Kotoko | - | JSM Béjaïa | 1:1 | ||
| I: 15.03.2013 19:00 | V: 07.04.2013 16:00 | Campeones: JSM Béjaïa | ||||
| I | Tusker FC | - | Al Ahly SC | 1:2 | ||
| V | Al Ahly SC | - | Tusker FC | 2:0 | ||
| I: 16.03.2013 14:00 | V: 07.04.2013 19:00 | Campeones: Al Ahly SC | ||||
| I | Zanaco FC | - | Orlando Pirates | 0:1 | ||
| V | Orlando Pirates | - | Zanaco FC | 2:1 | ||
| I: 16.03.2013 14:00 | V: 06.04.2013 20:15 | Campeones: Orlando Pirates | ||||
| I | Centre Chiefs | - | TP Mazembe | 0:1 | ||
| V | TP Mazembe | - | Centre Chiefs | 6:0 | ||
| I: 16.03.2013 15:00 | V: 07.04.2013 15:30 | Campeones: TP Mazembe | ||||
| I | Kano Pillars | - | AC Léopards | 4:1 | ||
| V | AC Léopards | - | Kano Pillars | 0:0 | ||
| I: 16.03.2013 16:00 | V: 06.04.2013 15:00 | Campeones: Kano Pillars | ||||
| I | Séwé Sport | - | Al Hilal Omdurman | 4:1 | ||
| V | Al Hilal Omdurman | - | Séwé Sport | 3:1 | ||
| I: 16.03.2013 16:30 | V: 05.04.2013 19:00 | Campeones: Séwé Sport | ||||
| I | ASFA Yennenga | - | ES Sétif | 2:1 | ||
| V | ES Sétif | - | ASFA Yennenga | 4:2 | ||
| I: 16.03.2013 17:00 | V: 05.04.2013 19:00 | Campeones: ES Sétif | ||||
| I | St. George SC | - | Djoliba AC | 2:0 | ||
| V | Djoliba AC | - | St. George SC | 1:1 | ||
| I: 17.03.2013 14:00 | V: 07.04.2013 18:30 | Campeones: St. George SC | ||||
| I | Vital'O | - | Enugu Rangers | 0:0 | ||
| V | Enugu Rangers | - | Vital'O | 2:0 | ||
| I: 17.03.2013 14:30 | V: 07.04.2013 16:00 | Campeones: Enugu Rangers | ||||
| I | CA Bizertin | - | Dynamos | 3:0 | ||
| V | Dynamos | - | CA Bizertin | 1:0 | ||
| I: 17.03.2013 15:00 | V: 07.04.2013 15:00 | Campeones: CA Bizertin | ||||
| I | CRD Libolo | - | Al Merrikh SC | 2:1 | ||
| V | Al Merrikh SC | - | CRD Libolo | 1:2 | ||
| I: 17.03.2013 15:00 | V: 06.04.2013 19:00 | Campeones: CRD Libolo | ||||
| I | AFAD Djékanou | - | Coton Sport Garoua | 0:1 | ||
| V | Coton Sport Garoua | - | AFAD Djékanou | 2:1 | ||
| I: 17.03.2013 16:30 | V: 07.04.2013 16:30 | Campeones: Coton Sport Garoua | ||||
| I | CD 1º de Agosto | - | Espérance de Tunis | 0:1 | ||
| V | Espérance de Tunis | - | CD 1º de Agosto | 1:0 (0:0) | ||
| I: 17.03.2013 17:00 | V: 06.04.2013 16:00 | Campeones: Espérance de Tunis | ||||
| I | Casa Sport | - | Stade Malien | 1:2 | ||
| V | Stade Malien | - | Casa Sport | 2:0 | ||
| I: 17.03.2013 18:00 | V: 06.04.2013 19:00 | Campeones: Stade Malien | ||||
