24.08.2016 17:00 Slovan Šimonovany - Inter Bratislava 5:4 pn.
31.08.2016 16:30 FC Pata - MFK Zemplín Michalovce 0:6 (0:1)
07.09.2016 16:00 FC Nový Život - TJ Slavoj Boleráz 3:0 (0:0)
13.09.2016 16:00 Oravské Veselé - Slovan Bratislava 1:6 (0:2)
16:30 Partizán Bardejov - MFK Ružomberok 3:4 (0:0, 0:0) pn.
14.09.2016 16:00 SK Svätý Jur - FC DAC 1904 1:6 (1:1)
16:00 FK Pohronie - ŠKF Sereď 1:3 (0:2)
16:00 Slovan Brvnište - FC Rohožník 4:2 pn.
16:00 OFK Malženice - MFK Nová Baňa 2:0 (1:0)
16:00 FK Dukla Banská Bystrica - 1. FC Tatran Prešov 0:1 (0:0)
16:00 ŠTK 1914 Šamorín - MFK Skalica 0:2 (0:2)
16:00 Slovan Ivanka - AFC Nové Mesto 3:4 (0:2)
16:00 Vyšné Opátske - FK Poprad 1:5 (1:3)
16:00 MFK Sobrance - ŠKM Liptovský Hrádok 1:5 (0:2)
16:00 TJ Višňové - ŠK Vinica 3:2
16:00 TJ Jasenov - FO ŽP Šport Podbrezová 0:2 (0:1)
16:00 Pivovar Šariš Veľký Šariš - Spartak Myjava 0:6
16:00 Tatran Liptovský Mikuláš - Lokomotíva Zvolen 1:0 (1:0)
16:00 Slavoj Spišská Belá - SK Odeva Lipany 3:4 pn.
16:00 FK 05 Levoča - Liptovská Štiavnica 1:3 pn.
16:00 Teplička nad Váhom - Zlaté Moravce 1:4
16:00 OFK-SIM Raslavice - FK Spišská Nová Ves 2:7
16:00 Družstevník Oravská Poruba - FC Lokomotíva Košice 0:4
16:00 FK Slovenské Ďarmoty - FK Slavoj Trebišov 2:0
16:00 TJ Iskra Borčice - Spartak Trnava 0:1 (0:0)
16:00 FK CSM Tisovec - ŠK Tvrdošín 2:1
17:30 MŠK Žilina - FC VSS Košice 3:0 (2:0)
19:00 FK Šalková - FC Nitra 0:1 (0:0)
21.09.2016 16:00 OFC Gabčíkovo - Slovan Duslo Šaľa 1:2
16:00 MŠK Púchov - AS Trenčín 0:3
16:00 Thermál Veľký Meder - MŠK Fomat Martin 3:1 pn.
16:30 Veľké Ludince - FK Senica 5:3 pn.