Copa Sudamericana   P V E D Goles
  En casa 1 0 1 0 1 : 1
  Fuera de casa 1 0 0 1 0 : 1
  2 0 1 1 1 : 2
Primera División   P V E D Goles
  En casa 20 7 5 8 27 : 25
  Fuera de casa 19 3 5 11 15 : 33
  39 10 10 19 42 : 58
Copa Inca   P V E D Goles
  En casa 2 1 1 0 3 : 0
  Fuera de casa 2 0 0 2 1 : 6
  4 1 1 2 4 : 6
Total   P V E D Goles
  En casa 23 8 7 8 31 : 26
  Fuera de casa 22 3 5 14 16 : 40
  En campo neutral 0 0 0 0 0 : 0
  45 11 12 22 47 : 66
Copa Sudamericana
2022 Eliminatoria previa FBC Melgar - Cienciano 1:0 (1:0)
2022 Eliminatoria previa Cienciano - FBC Melgar 1:1 (0:1)
Primera División
2023 Clausura 12. Jornada Cienciano - FBC Melgar 0:1 (0:0)
2023 Apertura 12. Jornada FBC Melgar - Cienciano 1:0 (1:0)
2022 Clausura 12. Jornada Cienciano - FBC Melgar 2:2 (0:1)
2022 Apertura 12. Jornada FBC Melgar - Cienciano 1:0 (0:0)
2021 Clausura 10. Jornada Cienciano - FBC Melgar 0:1 (0:1)
2021 Apertura 9. Jornada FBC Melgar - Cienciano 3:0 (3:0)
2020 Apertura 13. Jornada Cienciano - FBC Melgar 3:1 (1:0)
2015 Clausura 12. Jornada FBC Melgar - Cienciano 5:1 (3:1)
2015 Apertura 12. Jornada Cienciano - FBC Melgar 1:3 (0:2)
2014 Clausura 1. Jornada Cienciano - FBC Melgar 0:2 (0:0)
2014 Apertura 1. Jornada FBC Melgar - Cienciano 0:0 (0:0)
2013 Descentralizado 1. Rd. 16. Jornada Cienciano - FBC Melgar 0:0 (0:0)
2013 Descentralizado 1. Rd. 1. Jornada FBC Melgar - Cienciano 1:2 (1:1)
2012 Descentralizado 1. Rd. 23. Jornada Cienciano - FBC Melgar 2:0 (0:0)
2012 Descentralizado 1. Rd. 8. Jornada FBC Melgar - Cienciano 3:0 (2:0)
2011 17. Jornada Cienciano - FBC Melgar 2:3 (1:2)
2011 2. Jornada FBC Melgar - Cienciano 0:4 (0:0)
2010 Descentralizado 2. Rd. Grupo B FBC Melgar - Cienciano 2:1 (2:1)
2010 Descentralizado 2. Rd. Grupo B Cienciano - FBC Melgar 0:1 (0:1)
2010 Descentralizado 1. Rd. 21. Jornada FBC Melgar - Cienciano 3:0 (1:0)
2010 Descentralizado 1. Rd. 6. Jornada Cienciano - FBC Melgar 1:1 (0:0)
2009 Descentralizado 2ª fase Grupo B Cienciano - FBC Melgar 1:4 (1:3)
2009 Descentralizado 2ª fase Grupo B FBC Melgar - Cienciano 0:0 (0:0)
2009 Descentralizado 1ª fase 16. Jornada FBC Melgar - Cienciano 2:2 (0:2)
2009 Descentralizado 1ª fase 1. Jornada Cienciano - FBC Melgar 2:1 (1:0)
2008 Clausura 17. Jornada Cienciano - FBC Melgar 3:1 (0:1)
2008 Clausura 3. Jornada FBC Melgar - Cienciano 1:0 (0:0)
2008 Apertura 17. Jornada Cienciano - FBC Melgar 1:0 (1:0)
2008 Apertura 4. Jornada FBC Melgar - Cienciano 1:0 (1:0)
2007 Clausura 20. Jornada Cienciano - FBC Melgar 0:0
2007 Clausura 9. Jornada FBC Melgar - Cienciano 4:1
2007 Apertura 19. Jornada FBC Melgar - Cienciano 2:2
2007 Apertura 8. Jornada Cienciano - FBC Melgar 2:3
2006 Clausura 22. Jornada FBC Melgar - Cienciano 1:2
2006 Clausura 11. Jornada Cienciano - FBC Melgar 2:0
2006 Apertura 21. Jornada FBC Melgar - Cienciano 0:0
2006 Apertura 10. Jornada Cienciano - FBC Melgar 1:1
2005 Clausura 23. Jornada Cienciano - FBC Melgar 4:0
2005 Clausura 10. Jornada FBC Melgar - Cienciano 3:0
Copa Inca
2015 Grupo A FBC Melgar - Cienciano 3:1 (1:0)
2015 Grupo A Cienciano - FBC Melgar 3:0 (2:0)
2014 13. Jornada FBC Melgar - Cienciano 3:0
2014 6. Jornada Cienciano - FBC Melgar 0:0

En el caso de que un partido se haya decidido en tanda de penaltis, en este historial encuentras el resultado tras 120 minutos jugados.