| 1. Jornada | 01.11.2016 | Anagennisi Karditsa | - | Aris Saloniki | 1:1 | ||||
| 8. Jornada | 04.01.2017 | Anagennisi Karditsa | - | Panelefsiniakos Elefsinas | 0:0 | ||||
| 12. Jornada | 22.01.2017 | Panegialios FC | - | Anagennisi Karditsa | 1:0 | ||||
| 16. Jornada | 19.02.2017 | OFI Heraklion | - | Anagennisi Karditsa | 5:0 | ||||
| 17. Jornada | 23.02.2017 | Anagennisi Karditsa | - | Lamia | 0:2 | ||||
| 21. Jornada | 18.03.2017 | Apollon Smyrnis | - | Anagennisi Karditsa | 2:0 | ||||
| 24. Jornada | 02.04.2017 | Anagennisi Karditsa | - | AEL Kalloni | 1:0 |  |
 |
||
| 27. Jornada | 24.04.2017 | AO Chania | - | Anagennisi Karditsa | 2:1 | ||||
| 29. Jornada | 07.05.2017 | Anagennisi Karditsa | - | Panegialios FC | 1:1 | ||||
| 31. Jornada | 21.05.2017 | Anagennisi Karditsa | - | Panserraikos | 2:1 | ||||
| 33. Jornada | 04.06.2017 | Anagennisi Karditsa | - | OFI Heraklion | 0:2 |
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