| 1. Jornada | 19.03.2006 | Zenit | - | FK Saturn | 1:1 | ||||
| 4. Jornada | 09.04.2006 | Krylia Sovetov | - | Zenit | 3:2 |  |
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| 5. Jornada | 15.04.2006 | Zenit | - | Luch-Energiya Vladivostok | 3:1 | |
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| 6. Jornada | 23.04.2006 | Spartak Nalchik | - | Zenit | 1:1 | |
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| 7. Jornada | 30.04.2006 | Zenit | - | Spartak Moskva | 1:4 | ||||
| 8. Jornada | 06.05.2006 | Lokomotiv Moskva | - | Zenit | 3:1 | ||||
| 9. Jornada | 14.05.2006 | Zenit | - | Rubin Kazan | 1:0 | ||||
| 3. Jornada | 17.05.2006 | Zenit | - | FK Rostov | 1:1 | ||||
| 28. Jornada | 06.07.2006 | Zenit | - | Dinamo Moskva | 0:0 | ||||
| 10. Jornada | 12.07.2006 | FK Moskva | - | Zenit | 0:0 | ||||
| 12. Jornada | 23.07.2006 | Zenit | - | Torpedo Moskva | 2:1 | ||||
| 13. Jornada | 30.07.2006 | Dinamo Moskva | - | Zenit | 2:2 | |
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| 14. Jornada | 06.08.2006 | Zenit | - | Shinnik Yaroslavl | 1:0 | ||||
| 16. Jornada | 20.08.2006 | FK Saturn | - | Zenit | 0:0 | ||||
| 19. Jornada | 17.09.2006 | Zenit | - | Krylia Sovetov | 1:0 | |
|||
| 21. Jornada | 01.10.2006 | Zenit | - | Spartak Nalchik | 4:0 | ||||
| 22. Jornada | 14.10.2006 | Spartak Moskva | - | Zenit | 1:0 | ||||
| 25. Jornada | 29.10.2006 | Zenit | - | FK Moskva | 1:1 |
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