| 32. Jornada | 02.03.2025 | FK Jablonec B | - | FK Mlada Boleslav B | 0:2 | ||||
| 18. Jornada | 09.03.2025 | FK Mlada Boleslav B | - | FK Pardubice B | 1:0 | ||||
| 23. Jornada | 13.04.2025 | FK Teplice B | - | FK Mlada Boleslav B | 1:3 | ||||
| 24. Jornada | 18.04.2025 | FK Mlada Boleslav B | - | Jiskra Ústí nad Orlicí | 0:0 |  |
|||
| 26. Jornada | 04.05.2025 | SK Zápy | - | FK Mlada Boleslav B | 2:2 | |
|||
| 33. Jornada | 07.05.2025 | FK Mlada Boleslav B | - | FC Hradec Králové B | 1:4 | ||||
| 27. Jornada | 10.05.2025 | FK Mlada Boleslav B | - | FK Ústí nad Labem | 0:3 | ||||
| 28. Jornada | 17.05.2025 | FK Baník Most-Souš | - | FK Mlada Boleslav B | 2:2 | |
|||
| 29. Jornada | 24.05.2025 | FK Mlada Boleslav B | - | Chlumec nad Cidlinou | 1:3 | ||||
| 30. Jornada | 31.05.2025 | Sokol Živanice | - | FK Mlada Boleslav B | 3:1 | ||||
| 31. Jornada | 04.06.2025 | FK Mlada Boleslav B | - | Slovan Liberec B | 2:1 |
República Checa