| 1. Jornada | 23.08.1998 | OFI Heraklion | - | Ethnikos Piraeus | 3:0 | ||||
| 2. Jornada | 30.08.1998 | Paniliakos Pyrgos | - | Ethnikos Piraeus | 2:0 | ||||
| 3. Jornada | 13.09.1998 | Ethnikos Piraeus | - | AO Proodeftiki | 0:2 | ||||
| 5. Jornada | 27.09.1998 | Ethnikos Piraeus | - | PAOK Saloniki | 1:1 | ||||
| 6. Jornada | 04.10.1998 | Ionikos Nikea | - | Ethnikos Piraeus | 5:0 | ||||
| 7. Jornada | 25.10.1998 | Ethnikos Piraeus | - | Aris Saloniki | 1:1 |  |
|||
| 8. Jornada | 01.11.1998 | AO Kavala | - | Ethnikos Piraeus | 3:0 | ||||
| 9. Jornada | 08.11.1998 | Ethnikos Piraeus | - | Panathinaikos | 0:0 | ||||
| 10. Jornada | 22.11.1998 | Ethnikos Piraeus | - | Panionios GSS | 0:4 | ||||
| 12. Jornada | 06.12.1998 | Ethnikos Piraeus | - | Skoda Xanthi | 1:1 | ||||
| 13. Jornada | 14.12.1998 | Olympiacos | - | Ethnikos Piraeus | 2:0 | ||||
| 24. Jornada | 21.03.1999 | Aris Saloniki | - | Ethnikos Piraeus | 4:0 | ||||
| 26. Jornada | 19.04.1999 | Panathinaikos | - | Ethnikos Piraeus | 5:1 | ||||
| 29. Jornada | 09.05.1999 | Skoda Xanthi | - | Ethnikos Piraeus | 2:0 | ||||
| 30. Jornada | 12.05.1999 | Ethnikos Piraeus | - | Olympiacos | 0:3 | ||||
| 31. Jornada | 16.05.1999 | AEK Athen | - | Ethnikos Piraeus | 2:0 |
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