| 3. Jornada | 26.11.2016 | Aiginiakos FC | - | Panthrakikos | 2:1 | ||||
| 4. Jornada | 04.12.2016 | Panthrakikos | - | Kissamikos | 1:0 | ||||
| 5. Jornada | 11.12.2016 | AEL Kalloni | - | Panthrakikos | 1:1 | ||||
| 6. Jornada | 18.12.2016 | Panthrakikos | - | Panelefsiniakos Elefsinas | 1:0 |  |
|||
| 7. Jornada | 22.12.2016 | AO Trikala | - | Panthrakikos | 3:0 | ||||
| 8. Jornada | 04.01.2017 | Panthrakikos | - | AO Chania | 0:2 | ||||
| 9. Jornada | 08.01.2017 | Panthrakikos | - | GS Kallithea | 2:1 | ||||
| 10. Jornada | 15.01.2017 | Panegialios FC | - | Panthrakikos | 3:0 | ||||
| 11. Jornada | 18.01.2017 | Panthrakikos | - | Agrotikos Asteras | 0:1 | ||||
| 12. Jornada | 22.01.2017 | Panserraikos | - | Panthrakikos | 0:0 |
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