| 10. Jornada | 19.03.2016 | Jaguares de Córdoba | - | Atlético Junior | 0:2 | ||||
| 11. Jornada | 03.04.2016 | Fortaleza FC | - | Atlético Junior | 1:2 | ||||
| 12. Jornada | 09.04.2016 | Atlético Junior | - | Atlético Nacional | 3:3 | ||||
| 13. Jornada | 17.04.2016 | Once Caldas | - | Atlético Junior | 0:0 | ||||
| 14. Jornada | 24.04.2016 | Atlético Junior | - | Boyacá Chicó | 1:1 | ||||
| 15. Jornada | 28.04.2016 | Millonarios | - | Atlético Junior | 3:1 |  |
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| 16. Jornada | 02.05.2016 | Atlético Junior | - | Atlético Bucaramanga | 1:1 | ||||
| 17. Jornada | 08.05.2016 | Atlético Junior | - | Deportivo Cali | 2:0 | ||||
| 18. Jornada | 15.05.2016 | Envigado FC | - | Atlético Junior | 1:1 | ||||
| 19. Jornada | 22.05.2016 | Atlético Junior | - | Cortuluá | 2:1 |  |
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