| 3. Jornada | 09.09.2006 | Atromitos | - | AEK Athen | 1:1 | ||||
| 4. Jornada | 17.09.2006 | AO Kerkyra | - | Atromitos | 1:0 |  |
|||
| 7. Jornada | 22.10.2006 | Atromitos | - | Olympiacos | 1:0 | ||||
| 8. Jornada | 29.10.2006 | Ionikos Nikea | - | Atromitos | 1:4 | ||||
| 9. Jornada | 05.11.2006 | Atromitos | - | Ergotelis | 2:1 | ||||
| 10. Jornada | 12.11.2006 | Skoda Xanthi | - | Atromitos | 1:0 | ||||
| 11. Jornada | 19.11.2006 | Atromitos | - | Panathinaikos | 0:4 | ||||
| 14. Jornada | 10.12.2006 | PAOK Saloniki | - | Atromitos | 0:3 |  |
 |
||
| 15. Jornada | 16.12.2006 | Atromitos | - | Aris Saloniki | 1:1 | |
|||
| 16. Jornada | 06.01.2007 | OFI Heraklion | - | Atromitos | 4:1 | ||||
| 17. Jornada | 14.01.2007 | Atromitos | - | AE Lárissa | 2:2 | ||||
| 18. Jornada | 21.01.2007 | AEK Athen | - | Atromitos | 3:0 | |
|||
| 20. Jornada | 03.02.2007 | Iraklis Saloniki | - | Atromitos | 2:3 | ||||
| 21. Jornada | 11.02.2007 | Atromitos | - | AO Egaleo | 1:1 | ||||
| 26. Jornada | 18.03.2007 | Panathinaikos | - | Atromitos | 1:2 | ||||
| 27. Jornada | 15.04.2007 | Atromitos | - | Panionios GSS | 0:1 |
Brasil