| 16. Jornada | 11.01.2004 | Paniliakos Pyrgos | - | Panionios GSS | 0:0 | ||||
| 17. Jornada | 18.01.2004 | Panionios GSS | - | Skoda Xanthi | 1:0 | ||||
| 18. Jornada | 25.01.2004 | OFI Heraklion | - | Panionios GSS | 1:1 |  |
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| 19. Jornada | 01.02.2004 | Panionios GSS | - | GS Kallithea | 0:0 | |
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| 20. Jornada | 07.02.2004 | AEK Athen | - | Panionios GSS | 0:1 |  |
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| 21. Jornada | 22.02.2004 | Panionios GSS | - | Ionikos Nikea | 0:2 | ||||
| 22. Jornada | 28.02.2004 | Iraklis Saloniki | - | Panionios GSS | 0:3 |  |
|
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| 24. Jornada | 21.03.2004 | Panionios GSS | - | AO Egaleo | 2:0 | ||||
| 25. Jornada | 03.04.2004 | Atromitos | - | Panionios GSS | 2:2 | |
|
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| 26. Jornada | 18.04.2004 | Panionios GSS | - | Aris Saloniki | 2:1 | |
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| 27. Jornada | 25.04.2004 | Olympiacos | - | Panionios GSS | 2:0 | ||||
| 28. Jornada | 02.05.2004 | Panionios GSS | - | PAOK Saloniki | 1:0 | |
Grecia