| 1. Jornada | 24.07.2009 | NK Inter Zaprešić | - | NK Varteks | 1:1 | ||||
| 6. Jornada | 29.08.2009 | HNK Cibalia | - | NK Varteks | 4:0 | ||||
| 7. Jornada | 13.09.2009 | NK Varteks | - | Hajduk Split | 0:3 | ||||
| 8. Jornada | 19.09.2009 | HNK Šibenik | - | NK Varteks | 2:1 | ||||
| 10. Jornada | 04.10.2009 | Dinamo Zagreb | - | NK Varteks | 2:1 | ||||
| 18. Jornada | 25.02.2010 | Lokomotiva Zagreb | - | NK Varteks | 2:0 | ||||
| 23. Jornada | 03.04.2010 | NK Varteks | - | HNK Šibenik | 5:1 | ||||
| 24. Jornada | 10.04.2010 | NK Karlovac | - | NK Varteks | 1:1 |  |
|||
| 25. Jornada | 14.04.2010 | NK Varteks | - | Dinamo Zagreb | 1:2 | ||||
| 26. Jornada | 17.04.2010 | NK Međimurje | - | NK Varteks | 0:0 | ||||
| 27. Jornada | 24.04.2010 | NK Varteks | - | NK Croatia Sesvete | 4:1 | |
|||
| 28. Jornada | 01.05.2010 | NK Osijek | - | NK Varteks | 1:1 | ||||
| 29. Jornada | 08.05.2010 | NK Varteks | - | NK Zadar | 1:0 | ||||
| 30. Jornada | 13.05.2010 | Slaven Belupo | - | NK Varteks | 2:3 |
Croacia