| 3. Jornada | 11.09.2016 | AEK Athen | - | Xanthi FC | 4:1 | ||||
| 4. Jornada | 17.09.2016 | Xanthi FC | - | Panionios GSS | 0:2 | ||||
| 5. Jornada | 25.09.2016 | PAOK Saloniki | - | Xanthi FC | 0:0 | ||||
| 6. Jornada | 03.10.2016 | Xanthi FC | - | Atromitos | 0:0 | ||||
| 8. Jornada | 22.10.2016 | Platanias Chanion | - | Xanthi FC | 0:1 | ||||
| 9. Jornada | 29.10.2016 | Xanthi FC | - | AO Kerkyra | 0:0 | ||||
| 12. Jornada | 27.11.2016 | Panetolikos | - | Xanthi FC | 2:3 | ||||
| 14. Jornada | 10.12.2016 | Xanthi FC | - | AE Lárissa | 1:0 | ||||
| 15. Jornada | 17.12.2016 | Veria FC | - | Xanthi FC | 0:4 | ||||
| 1. Jornada | 03.01.2017 | AEP Iraklis FC | - | Xanthi FC | 0:1 | ||||
| 11. Jornada | 15.01.2017 | Xanthi FC | - | PAS Giannina | 2:0 | ||||
| 16. Jornada | 18.01.2017 | Xanthi FC | - | AEP Iraklis FC | 3:1 | ||||
| 17. Jornada | 21.01.2017 | Olympiacos | - | Xanthi FC | 2:0 | ||||
| 18. Jornada | 28.01.2017 | Xanthi FC | - | AEK Athen | 0:0 | ||||
| 19. Jornada | 05.02.2017 | Panionios GSS | - | Xanthi FC | 2:0 | ||||
| 26. Jornada | 01.04.2017 | PAS Giannina | - | Xanthi FC | 1:1 |
Grecia