| 23. Jornada | 22.01.2000 | Córdoba | - | RC Recreativo | 2:1 |  |
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| 24. Jornada | 30.01.2000 | CD Toledo | - | Córdoba | 0:3 | ||||
| 25. Jornada | 06.02.2000 | Córdoba | - | CP Mérida | 3:0 | ||||
| 26. Jornada | 13.02.2000 | Atlético B | - | Córdoba | 0:0 |  |
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| 27. Jornada | 20.02.2000 | Córdoba | - | Leganés | 2:1 | ||||
| 28. Jornada | 27.02.2000 | Osasuna | - | Córdoba | 0:2 | ||||
| 29. Jornada | 05.03.2000 | Córdoba | - | SD Compostela | 1:0 | |
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| 31. Jornada | 18.03.2000 | Las Palmas | - | Córdoba | 1:1 | ||||
| 32. Jornada | 25.03.2000 | Córdoba | - | CD Logroñés | 1:0 | |
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| 33. Jornada | 02.04.2000 | UE Lleida | - | Córdoba | 1:0 | ||||
| 34. Jornada | 09.04.2000 | Córdoba | - | UD Salamanca | 0:0 | ||||
| 35. Jornada | 16.04.2000 | Albacete | - | Córdoba | 1:0 | |
|||
| 37. Jornada | 30.04.2000 | Getafe | - | Córdoba | 0:1 | ||||
| 38. Jornada | 06.05.2000 | Córdoba | - | Eibar | 1:1 | ||||
| 39. Jornada | 13.05.2000 | Elche | - | Córdoba | 2:1 | ||||
| 40. Jornada | 20.05.2000 | Córdoba | - | Villarreal | 2:4 | ||||
| 41. Jornada | 28.05.2000 | Levante | - | Córdoba | 3:0 | |
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| 42. Jornada | 04.06.2000 | Córdoba | - | Tenerife | 2:1 | |
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