| 4. Jornada | 20.09.1998 | Ionikos Nikea | - | AO Kavala | 4:2 |  |
|||
| 5. Jornada | 26.09.1998 | Panathinaikos | - | Ionikos Nikea | 2:1 | ||||
| 6. Jornada | 04.10.1998 | Ionikos Nikea | - | Ethnikos Piraeus | 5:0 | ||||
| 7. Jornada | 25.10.1998 | Iraklis Saloniki | - | Ionikos Nikea | 2:1 | ||||
| 8. Jornada | 01.11.1998 | Ionikos Nikea | - | Skoda Xanthi | 0:1 | |
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| 16. Jornada | 23.01.1999 | AO Proodeftiki | - | Ionikos Nikea | 0:0 | |
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| 19. Jornada | 14.02.1999 | Panionios GSS | - | Ionikos Nikea | 0:2 | ||||
| 21. Jornada | 28.02.1999 | AO Kavala | - | Ionikos Nikea | 1:3 | ||||
| 25. Jornada | 04.04.1999 | Skoda Xanthi | - | Ionikos Nikea | 2:2 | |
|||
| 29. Jornada | 09.05.1999 | Ionikos Nikea | - | Panelefsiniakos Elefsinas | 3:0 | ||||
| 30. Jornada | 12.05.1999 | Veria FC | - | Ionikos Nikea | 0:2 | ||||
| 31. Jornada | 16.05.1999 | Ionikos Nikea | - | OFI Heraklion | 2:0 | ||||
| 32. Jornada | 19.05.1999 | Paniliakos Pyrgos | - | Ionikos Nikea | 1:4 | ||||
| 33. Jornada | 23.05.1999 | Ionikos Nikea | - | AO Proodeftiki | 2:0 | ||||
| 34. Jornada | 30.05.1999 | Ethnikos Asteras | - | Ionikos Nikea | 1:1 | |
Grecia