| 19. Jornada | 29.01.2012 | PAS Giannina | - | Panetolikos | 1:0 | ||||
| 20. Jornada | 05.02.2012 | Panetolikos | - | Atromitos | 1:1 | ||||
| 6. Jornada | 08.02.2012 | Panetolikos | - | Doxa Dramas FC | 0:2 | ||||
| 21. Jornada | 12.02.2012 | Doxa Dramas FC | - | Panetolikos | 2:1 | ||||
| 23. Jornada | 03.03.2012 | Skoda Xanthi | - | Panetolikos | 0:1 | ||||
| 24. Jornada | 11.03.2012 | Panetolikos | - | Ergotelis | 2:0 | ||||
| 25. Jornada | 18.03.2012 | Panetolikos | - | PAOK Saloniki | 1:1 | ||||
| 26. Jornada | 25.03.2012 | AEK Athen | - | Panetolikos | 1:0 | ||||
| 28. Jornada | 08.04.2012 | OFI Heraklion | - | Panetolikos | 1:0 |
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