| 21. Jornada | 08.01.2000 | Villarreal | - | CD Logroñés | 1:0 |  |
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| 23. Jornada | 23.01.2000 | CD Logroñés | - | Tenerife | 0:0 | |
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| 24. Jornada | 30.01.2000 | Sporting | - | CD Logroñés | 1:4 | |
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| 25. Jornada | 06.02.2000 | CD Logroñés | - | RC Recreativo | 0:3 | |
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| 26. Jornada | 13.02.2000 | CD Toledo | - | CD Logroñés | 2:1 | ||||
| 27. Jornada | 20.02.2000 | CD Logroñés | - | CP Mérida | 1:2 | ||||
| 28. Jornada | 27.02.2000 | Atlético B | - | CD Logroñés | 0:1 | ||||
| 29. Jornada | 05.03.2000 | CD Logroñés | - | Leganés | 0:1 | ||||
| 30. Jornada | 11.03.2000 | Osasuna | - | CD Logroñés | 2:0 | |
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| 31. Jornada | 19.03.2000 | CD Logroñés | - | SD Compostela | 3:1 | ||||
| 32. Jornada | 25.03.2000 | Córdoba | - | CD Logroñés | 1:0 | ||||
| 33. Jornada | 01.04.2000 | CD Logroñés | - | Las Palmas | 1:1 | ||||
| 34. Jornada | 08.04.2000 | CD Logroñés | - | CF Extremadura | 1:1 | ||||
| 35. Jornada | 15.04.2000 | UE Lleida | - | CD Logroñés | 1:0 | ||||
| 36. Jornada | 23.04.2000 | CD Logroñés | - | UD Salamanca | 0:0 | ||||
| 41. Jornada | 28.05.2000 | Elche | - | CD Logroñés | 2:1 | ||||
| 42. Jornada | 04.06.2000 | CD Logroñés | - | Villarreal | 1:0 |
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