| 20. Jornada | 02.03.2013 | Spartak Trnava | - | FC Nitra | 2:0 | ||||
| 22. Jornada | 15.03.2013 | FK Senica | - | FC Nitra | 2:1 |  |
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| 23. Jornada | 30.03.2013 | AS Trenčín | - | FC Nitra | 3:0 | ||||
| 24. Jornada | 02.04.2013 | FC Nitra | - | MFK Ružomberok | 3:0 | ||||
| 26. Jornada | 14.04.2013 | Spartak Myjava | - | FC Nitra | 0:0 | ||||
| 27. Jornada | 20.04.2013 | FC Nitra | - | FK Dukla Banská Bystrica | 3:1 | ||||
| 30. Jornada | 23.04.2013 | MŠK Žilina | - | FC Nitra | 1:2 | ||||
| 28. Jornada | 27.04.2013 | 1. FC Tatran Prešov | - | FC Nitra | 0:1 | ||||
| 32. Jornada | 22.05.2013 | Slovan Bratislava | - | FC Nitra | 4:0 |
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