| Eliminatoria previa | 06.03.2024 | Deportes Tolima | - | Independiente Medellín | 2:4 pn. | ||||
| Grupo A | 11.04.2024 | Independiente Medellín | - | César Vallejo | 4:2 |  |
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| Grupo A | 26.04.2024 | Independiente Medellín | - | Defensa y Justicia | 2:1 | |
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| Grupo A | 08.05.2024 | César Vallejo | - | Independiente Medellín | 1:5 | |
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| Grupo A | 15.05.2024 | Defensa y Justicia | - | Independiente Medellín | 1:1 | |
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| Grupo A | 30.05.2024 | Independiente Medellín | - | Always Ready | 4:0 | |
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| Octavos de final | 15.08.2024 | Palestino | - | Independiente Medellín | 2:2 | ||||
| Octavos de final | 22.08.2024 | Independiente Medellín | - | Palestino | 4:0 | ||||
| Cuartos de final | 19.09.2024 | CA Lanús | - | Independiente Medellín | 0:0 | |
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| Cuartos de final | 26.09.2024 | Independiente Medellín | - | CA Lanús | 5:6 pn. | |
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