| 1. Jornada | 04.07.2016 | Santa Fe | - | Boyacá Chicó | 1:0 | ||||
| 2. Jornada | 10.07.2016 | Boyacá Chicó | - | Deportivo Pasto | 0:2 | ||||
| 4. Jornada | 19.07.2016 | Boyacá Chicó | - | Jaguares de Córdoba | 0:1 |  |
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| 5. Jornada | 23.07.2016 | Águilas Doradas | - | Boyacá Chicó | 2:1 | |
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| 6. Jornada | 31.07.2016 | Boyacá Chicó | - | Deportes Tolima | 0:4 | |
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| 7. Jornada | 06.08.2016 | Fortaleza FC | - | Boyacá Chicó | 2:1 | ||||
| 9. Jornada | 21.08.2016 | Boyacá Chicó | - | Once Caldas | 2:1 | ||||
| 3. Jornada | 25.08.2016 | Alianza Petrolera | - | Boyacá Chicó | 1:0 | ||||
| 10. Jornada | 28.08.2016 | Patriotas FC | - | Boyacá Chicó | 1:0 | ||||
| 11. Jornada | 12.09.2016 | Deportivo Cali | - | Boyacá Chicó | 2:0 |  |
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| 20. Jornada | 21.11.2016 | Boyacá Chicó | - | Patriotas FC | 1:2 |
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