| 1. Jornada | 03.07.2016 | Patriotas FC | - | Millonarios | 1:0 | ||||
| 2. Jornada | 10.07.2016 | Millonarios | - | Santa Fe | 1:0 | ||||
| 4. Jornada | 18.07.2016 | Millonarios | - | Alianza Petrolera | 1:0 |  |
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| 11. Jornada | 22.07.2016 | Millonarios | - | Once Caldas | 1:1 | |
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| 5. Jornada | 24.07.2016 | Jaguares de Córdoba | - | Millonarios | 2:1 |  |
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| 6. Jornada | 31.07.2016 | Millonarios | - | Águilas Doradas | 0:0 | ||||
| 7. Jornada | 08.08.2016 | Deportes Tolima | - | Millonarios | 3:1 | ||||
| 14. Jornada | 11.08.2016 | Millonarios | - | Atlético Bucaramanga | 0:3 | ||||
| 8. Jornada | 14.08.2016 | Millonarios | - | Fortaleza FC | 3:2 | ||||
| 13. Jornada | 18.08.2016 | Millonarios | - | Deportivo Cali | 1:0 | |
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| 9. Jornada | 22.08.2016 | Atlético Nacional | - | Millonarios | 1:0 | ||||
| 10. Jornada | 29.08.2016 | Santa Fe | - | Millonarios | 1:2 | ||||
| 3. Jornada | 06.09.2016 | Deportivo Pasto | - | Millonarios | 1:1 | |
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| 12. Jornada | 15.09.2016 | Boyacá Chicó | - | Millonarios | 0:1 | ||||
| 17. Jornada | 24.10.2016 | Cortuluá | - | Millonarios | 2:3 | ||||
| 19. Jornada | 07.11.2016 | Atlético Huila | - | Millonarios | 0:3 | |
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