| 13. Jornada | 03.12.2006 | OFI Heraklion | - | Skoda Xanthi | 0:2 | ||||
| 14. Jornada | 10.12.2006 | Skoda Xanthi | - | AEK Athen | 0:0 | ||||
| 15. Jornada | 16.12.2006 | Iraklis Saloniki | - | Skoda Xanthi | 1:0 | ||||
| 16. Jornada | 07.01.2007 | Skoda Xanthi | - | Olympiacos | 0:0 | ||||
| 20. Jornada | 04.02.2007 | Aris Saloniki | - | Skoda Xanthi | 1:0 | ||||
| 27. Jornada | 15.04.2007 | PAOK Saloniki | - | Skoda Xanthi | 1:0 | ||||
| 28. Jornada | 22.04.2007 | Skoda Xanthi | - | OFI Heraklion | 4:1 | ||||
| 29. Jornada | 29.04.2007 | AEK Athen | - | Skoda Xanthi | 0:0 | ||||
| 30. Jornada | 13.05.2007 | Skoda Xanthi | - | Iraklis Saloniki | 1:2 |
Portugal