| 4. Jornada | 20.09.1999 | Atalanta | - | Nápoles | 1:0 | ||||
| 5. Jornada | 26.09.1999 | Ternana Calcio | - | Atalanta | 1:1 | ||||
| 6. Jornada | 03.10.1999 | Atalanta | - | Pescara Calcio | 3:1 | ||||
| 7. Jornada | 10.10.1999 | Sampdoria | - | Atalanta | 1:0 | ||||
| 8. Jornada | 24.10.1999 | Atalanta | - | AC Pistoiese | 3:1 | ||||
| 9. Jornada | 31.10.1999 | AC Monza | - | Atalanta | 1:0 | ||||
| 10. Jornada | 07.11.1999 | Brescia Calcio | - | Atalanta | 0:0 | ||||
| 17. Jornada | 06.01.2000 | Fermana FC | - | Atalanta | 1:0 | ||||
| 18. Jornada | 09.01.2000 | Atalanta | - | AC Savoia 1908 | 4:1 | ||||
| 19. Jornada | 16.01.2000 | AC Cesena | - | Atalanta | 1:1 | ||||
| 20. Jornada | 23.01.2000 | Atalanta | - | Cosenza Calcio | 1:1 |  |
|||
| 21. Jornada | 30.01.2000 | Treviso FBC | - | Atalanta | 2:1 | ||||
| 24. Jornada | 27.02.2000 | Atalanta | - | Ternana Calcio | 1:2 |  |
|||
| 25. Jornada | 03.03.2000 | Pescara Calcio | - | Atalanta | 0:1 | ||||
| 26. Jornada | 13.03.2000 | Atalanta | - | Sampdoria | 3:3 | ||||
| 30. Jornada | 09.04.2000 | Salernitana Sport | - | Atalanta | 0:1 | ||||
| 35. Jornada | 21.05.2000 | Alzano Virescit | - | Atalanta | 0:0 |
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