| 13. Jornada | 03.01.1999 | Perth Glory | - | Carlton Blues | 3:0 | ||||
| 14. Jornada | 10.01.1999 | Melbourne Knights | - | Perth Glory | 1:1 | ||||
| 15. Jornada | 17.01.1999 | Perth Glory | - | Wollongong City Wolves | 0:1 | ||||
| 16. Jornada | 24.01.1999 | Perth Glory | - | Adelaide City Zebras | 1:2 | ||||
| 17. Jornada | 26.01.1999 | Northern Spirit | - | Perth Glory | 1:0 | ||||
| 18. Jornada | 31.01.1999 | Perth Glory | - | Newcastle Breakers | 0:1 | ||||
| 19. Jornada | 07.02.1999 | Adelaide Sharks | - | Perth Glory | 1:3 | ||||
| 20. Jornada | 14.02.1999 | Perth Glory | - | Brisbane Strikers | 6:0 | ||||
| 21. Jornada | 21.02.1999 | Sydney United Pumas | - | Perth Glory | 3:4 | ||||
| 22. Jornada | 28.02.1999 | Perth Glory | - | Canberra Cosmos | 3:1 | ||||
| 24. Jornada | 14.03.1999 | Perth Glory | - | Gippsland Falcons | 1:0 |  |
|||
| 26. Jornada | 28.03.1999 | Perth Glory | - | UTS Sydney Olympic | 2:2 | ||||
| 23. Jornada | 31.03.1999 | South Melbourne Lakers | - | Perth Glory | 2:1 | ||||
| 28. Jornada | 11.04.1999 | Carlton Blues | - | Perth Glory | 1:2 | ||||
| 30. Jornada | 25.04.1999 | Wollongong City Wolves | - | Perth Glory | 3:3 |  |
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