| 7. Jornada | 30.04.2006 | FK Moskva | - | Lokomotiv Moskva | 0:1 | ||||
| 8. Jornada | 07.05.2006 | Rubin Kazan | - | FK Moskva | 2:0 | ||||
| 9. Jornada | 14.05.2006 | FK Moskva | - | CSKA Moscú | 0:1 | ||||
| 10. Jornada | 12.07.2006 | FK Moskva | - | Zenit | 0:0 | ||||
| 11. Jornada | 19.07.2006 | FK Moskva | - | Torpedo Moskva | 1:1 | ||||
| 12. Jornada | 25.07.2006 | FK Moskva | - | Dinamo Moskva | 1:1 | ||||
| 13. Jornada | 30.07.2006 | Shinnik Yaroslavl | - | FK Moskva | 1:2 |  |
|||
| 14. Jornada | 06.08.2006 | FK Moskva | - | FK Tom Tomsk | 0:0 | ||||
| 15. Jornada | 12.08.2006 | FK Saturn | - | FK Moskva | 1:1 | ||||
| 22. Jornada | 14.10.2006 | Lokomotiv Moskva | - | FK Moskva | 0:1 | ||||
| 25. Jornada | 29.10.2006 | Zenit | - | FK Moskva | 1:1 | ||||
| 29. Jornada | 18.11.2006 | FK Tom Tomsk | - | FK Moskva | 1:0 | ||||
| 30. Jornada | 26.11.2006 | FK Moskva | - | FK Saturn | 2:1 |
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