| 4. Jornada | 03.04.2004 | CSKA Moscú | - | Zenit | 3:3 | ||||
| 5. Jornada | 07.04.2004 | Zenit | - | Rubin Kazan | 4:3 | ||||
| 8. Jornada | 25.04.2004 | Torpedo Moskva | - | Zenit | 3:1 | ||||
| 9. Jornada | 01.05.2004 | Spartak Moskva | - | Zenit | 0:3 | ||||
| 13. Jornada | 22.05.2004 | Zenit | - | Kuban Krasnodar (1928-2018) | 1:0 | ||||
| 14. Jornada | 03.07.2004 | FK Rostov | - | Zenit | 2:1 | ||||
| 15. Jornada | 07.07.2004 | Zenit | - | Alania Vladikavkaz | 3:2 | ||||
| 16. Jornada | 10.07.2004 | Kuban Krasnodar (1928-2018) | - | Zenit | 1:3 | ||||
| 17. Jornada | 17.07.2004 | Zenit | - | Lokomotiv Moskva | 0:2 |  |
|||
| 18. Jornada | 25.07.2004 | Alania Vladikavkaz | - | Zenit | 0:3 | ||||
| 19. Jornada | 15.08.2004 | Zenit | - | FK Rostov | 0:1 | ||||
| 20. Jornada | 21.08.2004 | Zenit | - | Spartak Moskva | 2:0 | ||||
| 21. Jornada | 30.08.2004 | Dinamo Moskva | - | Zenit | 0:2 |  |
|||
| 23. Jornada | 20.09.2004 | Zenit | - | Torpedo Moskva | 3:1 | ||||
| 28. Jornada | 31.10.2004 | FK Saturn | - | Zenit | 1:3 | ||||
| 29. Jornada | 08.11.2004 | Zenit | - | FK Moskva | 2:3 | ||||
| 30. Jornada | 12.11.2004 | Rotor Volgograd (1929-2005) | - | Zenit | 2:5 |
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