| 6. Jornada | 29.08.1999 | Bayer Leverkusen II | - | 1. FC Saarbrücken | 0:1 |  |
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| 13. Jornada | 17.10.1999 | SC Paderborn 07 | - | Bayer Leverkusen II | 2:2 | ||||
| 14. Jornada | 24.10.1999 | Bayer Leverkusen II | - | SV 07 Elversberg | 0:3 | ||||
| 15. Jornada | 31.10.1999 | Borussia Dortmund II | - | Bayer Leverkusen II | 0:0 |
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