| Primera etapa | 07.07.2016 | Beitar Jerusalem | - | Sloboda Tuzla | 1:0 | ||||
| Segunda etapa | 14.07.2016 | Beitar Jerusalem | - | Omonia Nikosia | 1:0 | ||||
| Segunda etapa | 21.07.2016 | Omonia Nikosia | - | Beitar Jerusalem | 3:2 | ||||
| Tercera ronda | 04.08.2016 | Beitar Jerusalem | - | FK Jelgava | 3:0 | ||||
| Playoffs | 17.08.2016 | Beitar Jerusalem | - | Saint-Étienne | 1:2 | ||||
| Playoffs | 25.08.2016 | Saint-Étienne | - | Beitar Jerusalem | 0:0 |
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