| 2. Jornada | 21.07.2012 | NK Maribor | - | FC Koper | 0:0 |  |
|||
| 3. Jornada | 28.07.2012 | FC Koper | - | NK Triglav | 0:0 | ||||
| 1. Jornada | 01.08.2012 | NK Aluminij | - | FC Koper | 0:3 | ||||
| 4. Jornada | 04.08.2012 | NK Domžale | - | FC Koper | 0:1 | ||||
| 26. Jornada | 30.03.2013 | Olimpija Ljubljana | - | FC Koper | 2:2 | ||||
| 28. Jornada | 13.04.2013 | FC Koper | - | NK Aluminij | 3:0 |  |
|||
| 29. Jornada | 20.04.2013 | FC Koper | - | NK Maribor | 2:1 | ||||
| 30. Jornada | 28.04.2013 | NK Triglav | - | FC Koper | 1:1 | ||||
| 31. Jornada | 08.05.2013 | FC Koper | - | NK Domžale | 3:0 | |
|||
| 32. Jornada | 11.05.2013 | Rudar Velenje | - | FC Koper | 1:4 | ||||
| 33. Jornada | 14.05.2013 | FC Koper | - | ND Gorica | 2:2 | |
|||
| 35. Jornada | 22.05.2013 | FC Koper | - | Olimpija Ljubljana | 0:1 | ||||
| 36. Jornada | 26.05.2013 | NK Celje | - | FC Koper | 2:2 | |
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