| 3. Jornada | 11.08.2012 | AJ Auxerre | - | CS Sedan | 1:0 | ||||
| 4. Jornada | 20.08.2012 | Le Mans FC | - | AJ Auxerre | 3:1 | ||||
| 5. Jornada | 24.08.2012 | AJ Auxerre | - | Stade Lavallois | 2:1 | ||||
| 6. Jornada | 31.08.2012 | Tours FC | - | AJ Auxerre | 1:0 | ||||
| 7. Jornada | 14.09.2012 | AJ Auxerre | - | FC Istres | 0:0 | ||||
| 8. Jornada | 22.09.2012 | Guingamp | - | AJ Auxerre | 4:3 | ||||
| 9. Jornada | 01.10.2012 | AJ Auxerre | - | AC Arles-Avignon | 2:1 | ||||
| 10. Jornada | 05.10.2012 | Havre AC | - | AJ Auxerre | 2:1 |  |
|||
| 11. Jornada | 20.10.2012 | AJ Auxerre | - | RC Lens | 1:2 |  |
|||
| 12. Jornada | 26.10.2012 | Dijon FCO | - | AJ Auxerre | 0:1 | |
|||
| 13. Jornada | 03.11.2012 | AJ Auxerre | - | Gazélec Ajaccio | 1:1 | |
|||
| 14. Jornada | 10.11.2012 | Mónaco | - | AJ Auxerre | 2:0 | ||||
| 15. Jornada | 24.11.2012 | AJ Auxerre | - | Nantes | 0:2 | ||||
| 16. Jornada | 30.11.2012 | LB Châteauroux | - | AJ Auxerre | 1:1 | ||||
| 17. Jornada | 11.12.2012 | AJ Auxerre | - | Chamois Niortais | 4:2 | |
|||
| 18. Jornada | 14.12.2012 | Angers | - | AJ Auxerre | 2:1 | ||||
| 20. Jornada | 12.01.2013 | AJ Auxerre | - | Caen | 1:2 |
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