| Primera etapa | 16.09.1987 | Panathinaikos | - | AJ Auxerre | 2:0 | ||||
| Primera etapa | 30.09.1987 | AJ Auxerre | - | Panathinaikos | 3:2 |  |
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| Segunda etapa | 21.10.1987 | Panathinaikos | - | Juventus | 1:0 | |
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| Segunda etapa | 04.11.1987 | Juventus | - | Panathinaikos | 3:2 | |
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| Octavos de final | 25.11.1987 | Budapest Honved SE | - | Panathinaikos | 5:2 | |
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| Octavos de final | 09.12.1987 | Panathinaikos | - | Budapest Honved SE | 5:1 | ||||
| Cuartos de final | 02.03.1988 | Panathinaikos | - | Club Brugge KV | 2:2 | |
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| Cuartos de final | 16.03.1988 | Club Brugge KV | - | Panathinaikos | 1:0 |
Grecia