| 16. Jornada | 06.01.2013 | Aris Saloniki | - | Panionios GSS | 2:1 | ||||
| 17. Jornada | 13.01.2013 | Panionios GSS | - | Veria FC | 1:1 | ||||
| 18. Jornada | 19.01.2013 | OFI Heraklion | - | Panionios GSS | 2:1 | ||||
| 19. Jornada | 26.01.2013 | Panionios GSS | - | Levadiakos | 2:1 | ||||
| 20. Jornada | 02.02.2013 | AEK Athen | - | Panionios GSS | 1:0 |  |
|||
| 21. Jornada | 10.02.2013 | Panionios GSS | - | PAS Giannina | 0:1 | |
|||
| 22. Jornada | 16.02.2013 | AO Kerkyra | - | Panionios GSS | 2:1 | ||||
| 24. Jornada | 03.03.2013 | PAOK Saloniki | - | Panionios GSS | 4:2 | ||||
| 25. Jornada | 11.03.2013 | Panionios GSS | - | Atromitos | 1:0 | ||||
| 26. Jornada | 17.03.2013 | Platanias Chanion | - | Panionios GSS | 2:1 | |
|||
| 27. Jornada | 01.04.2013 | Panionios GSS | - | Asteras Tripolis | 2:1 | ||||
| 28. Jornada | 07.04.2013 | Panathinaikos | - | Panionios GSS | 0:0 | |
|||
| 30. Jornada | 21.04.2013 | Olympiacos | - | Panionios GSS | 2:1 | |
Grecia