| 1. Jornada | 31.08.2008 | Panionios GSS | - | Skoda Xanthi | 0:1 |  |
|||
| 2. Jornada | 13.09.2008 | Panserraikos | - | Panionios GSS | 0:1 | ||||
| 3. Jornada | 21.09.2008 | Panionios GSS | - | OFI Heraklion | 1:1 | ||||
| 4. Jornada | 28.09.2008 | Panionios GSS | - | AEK Athen | 2:2 | ||||
| 10. Jornada | 16.11.2008 | Panionios GSS | - | Iraklis Saloniki | 0:2 | |
|||
| 11. Jornada | 23.11.2008 | Panionios GSS | - | Levadiakos | 1:0 | ||||
| 12. Jornada | 30.11.2008 | Olympiacos | - | Panionios GSS | 4:1 | ||||
| 16. Jornada | 03.01.2009 | Skoda Xanthi | - | Panionios GSS | 0:0 | ||||
| 17. Jornada | 10.01.2009 | Panionios GSS | - | Panserraikos | 2:0 | ||||
| 20. Jornada | 01.02.2009 | Panionios GSS | - | Panthrakikos | 3:0 | ||||
| 21. Jornada | 07.02.2009 | Aris Saloniki | - | Panionios GSS | 1:0 | ||||
| 29. Jornada | 12.04.2009 | Panionios GSS | - | Thrasyvoulos Fylis | 4:1 | ||||
| 30. Jornada | 26.04.2009 | Asteras Tripolis | - | Panionios GSS | 3:4 |
Grecia