| 5. Jornada | 30.03.2016 | FK Trakai | - | Utenis Utena | 1:0 | ||||
| 6. Jornada | 10.04.2016 | FK Jonava | - | FK Trakai | 0:1 |  |
|||
| 7. Jornada | 17.04.2016 | FK Trakai | - | FK Atlantas | 2:0 | ||||
| 8. Jornada | 20.04.2016 | FK Trakai | - | FK Žalgiris | 1:0 | ||||
| 9. Jornada | 28.04.2016 | FK Trakai | - | Kauno Žalgiris | 0:0 | ||||
| 10. Jornada | 03.05.2016 | FC Stumbras | - | FK Trakai | 0:0 | ||||
| 11. Jornada | 07.05.2016 | FK Trakai | - | FK Sūduva | 3:1 | ||||
| 12. Jornada | 19.05.2016 | Utenis Utena | - | FK Trakai | 0:2 | ||||
| 13. Jornada | 22.05.2016 | FK Trakai | - | FK Jonava | 3:0 | ||||
| 14. Jornada | 09.06.2016 | FK Atlantas | - | FK Trakai | 2:2 | ||||
| 15. Jornada | 15.06.2016 | FK Žalgiris | - | FK Trakai | 3:1 | |
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| 16. Jornada | 21.06.2016 | Kauno Žalgiris | - | FK Trakai | 0:4 |
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