| 12. Jornada | 19.05.2016 | Utenis Utena | - | FK Trakai | 0:2 | ||||
| 13. Jornada | 22.05.2016 | FK Trakai | - | FK Jonava | 3:0 | ||||
| 17. Jornada | 14.07.2016 | FK Trakai | - | FC Stumbras | 0:2 | ||||
| 18. Jornada | 20.07.2016 | FK Sūduva | - | FK Trakai | 1:0 | ||||
| 24. Jornada | 07.09.2016 | FC Stumbras | - | FK Trakai | 1:4 |  |
Lituania