| 1. Jornada | 05.03.2016 | FK Atlantas | - | FC Stumbras | 2:0 | ||||
| 2. Jornada | 09.03.2016 | FK Sūduva | - | FK Atlantas | 1:0 |  |
|||
| 3. Jornada | 16.03.2016 | FK Atlantas | - | Utenis Utena | 1:0 | ||||
| 4. Jornada | 20.03.2016 | FK Jonava | - | FK Atlantas | 0:1 | |
|||
| 5. Jornada | 02.04.2016 | FK Atlantas | - | Kauno Žalgiris | 3:1 | ||||
| 6. Jornada | 06.04.2016 | FK Atlantas | - | FK Žalgiris | 2:1 | ||||
| 7. Jornada | 17.04.2016 | FK Trakai | - | FK Atlantas | 2:0 | |
|||
| 8. Jornada | 21.04.2016 | FC Stumbras | - | FK Atlantas | 2:3 | ||||
| 9. Jornada | 27.04.2016 | FK Atlantas | - | FK Sūduva | 1:2 | ||||
| 10. Jornada | 05.05.2016 | Utenis Utena | - | FK Atlantas | 0:2 | ||||
| 11. Jornada | 08.05.2016 | FK Atlantas | - | FK Jonava | 2:0 | ||||
| 12. Jornada | 17.05.2016 | Kauno Žalgiris | - | FK Atlantas | 0:2 | ||||
| 13. Jornada | 21.05.2016 | FK Žalgiris | - | FK Atlantas | 1:0 | ||||
| 14. Jornada | 09.06.2016 | FK Atlantas | - | FK Trakai | 2:2 | |
|||
| 16. Jornada | 24.06.2016 | FK Sūduva | - | FK Atlantas | 3:3 |
Lituania