| 1. Jornada | 27.08.2012 | Panionios GSS | - | Aris Saloniki | 1:0 |  |
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| 2. Jornada | 01.09.2012 | Veria FC | - | Panionios GSS | 0:1 | ||||
| 3. Jornada | 17.09.2012 | Panionios GSS | - | OFI Heraklion | 2:1 | ||||
| 4. Jornada | 22.09.2012 | Levadiakos | - | Panionios GSS | 3:0 | ||||
| 5. Jornada | 29.09.2012 | Panionios GSS | - | AEK Athen | 1:0 | |
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| 12. Jornada | 25.11.2012 | Asteras Tripolis | - | Panionios GSS | 2:1 | ||||
| 13. Jornada | 02.12.2012 | Panionios GSS | - | Panathinaikos | 1:2 | ||||
| 15. Jornada | 15.12.2012 | Panionios GSS | - | Olympiacos | 1:2 |  |
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| 23. Jornada | 24.02.2013 | Panionios GSS | - | Panthrakikos | 2:0 | ||||
| 24. Jornada | 03.03.2013 | PAOK Saloniki | - | Panionios GSS | 4:2 | ||||
| 28. Jornada | 07.04.2013 | Panathinaikos | - | Panionios GSS | 0:0 | ||||
| 29. Jornada | 14.04.2013 | Panionios GSS | - | Skoda Xanthi | 3:3 |  |
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| 30. Jornada | 21.04.2013 | Olympiacos | - | Panionios GSS | 2:1 |
Grecia