| Segunda etapa | 24.08.2016 | Banfield | - | San Lorenzo | 2:0 | ||||
| Segunda etapa | 14.09.2016 | San Lorenzo | - | Banfield | 4:1 |  |
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| Octavos de final | 23.09.2016 | San Lorenzo | - | Deportivo La Guaira | 2:1 | ||||
| Octavos de final | 30.09.2016 | Deportivo La Guaira | - | San Lorenzo | 0:2 |  |
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| Cuartos de final | 21.10.2016 | San Lorenzo | - | Palestino | 2:0 | ||||
| Cuartos de final | 28.10.2016 | Palestino | - | San Lorenzo | 1:0 | ||||
| Semifinales | 03.11.2016 | San Lorenzo | - | Chapecoense | 1:1 | ||||
| Semifinales | 24.11.2016 | Chapecoense | - | San Lorenzo | 0:0 |
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