| 1. Jornada | 21.07.2008 | MŠK Žilina | - | Zlaté Moravce | 3:0 |  |
|||
| 3. Jornada | 03.08.2008 | MŠK Žilina | - | 1. FC Tatran Prešov | 5:1 | |
|||
| 4. Jornada | 09.08.2008 | MŠK Žilina | - | FC Nitra | 5:0 | |
|||
| 6. Jornada | 23.08.2008 | MŠK Žilina | - | Slovan Bratislava | 1:0 | |
|||
| 16. Jornada | 15.11.2008 | MŠK Žilina | - | Spartak Trnava | 5:1 | |
|||
| 22. Jornada | 22.03.2009 | MŠK Žilina | - | FC DAC 1904 | 5:1 | |
|||
| 27. Jornada | 03.05.2009 | Spartak Trnava | - | MŠK Žilina | 1:1 | |
|||
| 32. Jornada | 26.05.2009 | MŠK Žilina | - | MFK Dubnica | 5:2 | |
República Checa