| Grupo A | 22.08.2016 | Defensor La Bocana | - | Deportivo Municipal | 1:2 | ||||
| Grupo A | 28.08.2016 | Real Garcilaso | - | Defensor La Bocana | 4:2 |  |
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| Grupo A | 10.09.2016 | Juan Aurich | - | Defensor La Bocana | 1:3 | ||||
| Grupo A | 18.09.2016 | Defensor La Bocana | - | Sporting Cristal | 1:2 |  |
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| Grupo A | 29.09.2016 | Defensor La Bocana | - | César Vallejo | 1:3 | |
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| Grupo A | 16.10.2016 | Unión Comercio | - | Defensor La Bocana | 1:1 | ||||
| Grupo A | 03.11.2016 | Sporting Cristal | - | Defensor La Bocana | 2:5 | ||||
| Grupo A | 18.11.2016 | Defensor La Bocana | - | FBC Melgar | 1:3 | ||||
| Grupo A | 23.11.2016 | César Vallejo | - | Defensor La Bocana | 1:1 | ||||
| Grupo A | 27.11.2016 | Defensor La Bocana | - | Unión Comercio | 3:3 |
Uruguay