| 3. Jornada | 14.03.2023 | FC Flora | - | JK Narva Trans | 5:0 | ||||
| 5. Jornada | 01.04.2023 | FC Flora | - | JK Tammeka | 1:1 | ||||
| 6. Jornada | 08.04.2023 | FC Kuressaare | - | FC Flora | 1:4 | ||||
| 7. Jornada | 16.04.2023 | FC Flora | - | Pärnu JK Vaprus | 4:0 |  |
 |
||
| 2. Jornada | 19.04.2023 | JK Nõmme Kalju | - | FC Flora | 2:2 | ||||
| 8. Jornada | 23.04.2023 | FC Flora | - | FCI Levadia | 0:2 | ||||
| 9. Jornada | 29.04.2023 | Paide Linnameeskond | - | FC Flora | 1:3 | ||||
| 10. Jornada | 03.05.2023 | JK Tammeka | - | FC Flora | 0:3 | ||||
| 11. Jornada | 07.05.2023 | FC Flora | - | JK Nõmme Kalju | 3:1 | |
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| 12. Jornada | 14.05.2023 | FC Kuressaare | - | FC Flora | 0:3 | ||||
| 16. Jornada | 07.06.2023 | FC Flora | - | Paide Linnameeskond | 0:0 | ||||
| 27. Jornada | 17.09.2023 | JK Nõmme Kalju | - | FC Flora | 0:0 | |
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| 28. Jornada | 22.09.2023 | FC Flora | - | JK Tallinna Kalev | 1:0 | ||||
| 29. Jornada | 27.09.2023 | JK Tammeka | - | FC Flora | 1:2 |
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