| 1. Jornada | 04.07.2016 | Santa Fe | - | Boyacá Chicó | 1:0 | ||||
| 2. Jornada | 10.07.2016 | Boyacá Chicó | - | Deportivo Pasto | 0:2 |  |
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| 4. Jornada | 19.07.2016 | Boyacá Chicó | - | Jaguares de Córdoba | 0:1 | ||||
| 5. Jornada | 23.07.2016 | Águilas Doradas | - | Boyacá Chicó | 2:1 | ||||
| 6. Jornada | 31.07.2016 | Boyacá Chicó | - | Deportes Tolima | 0:4 | ||||
| 10. Jornada | 28.08.2016 | Patriotas FC | - | Boyacá Chicó | 1:0 | |
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| 11. Jornada | 12.09.2016 | Deportivo Cali | - | Boyacá Chicó | 2:0 | ||||
| 12. Jornada | 15.09.2016 | Boyacá Chicó | - | Millonarios | 0:1 | ||||
| 13. Jornada | 17.09.2016 | Atlético Bucaramanga | - | Boyacá Chicó | 2:0 | ||||
| 14. Jornada | 26.09.2016 | Boyacá Chicó | - | Atlético Junior | 2:2 | ||||
| 15. Jornada | 09.10.2016 | Envigado FC | - | Boyacá Chicó | 3:1 | |
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