| 3. Jornada | 13.08.2016 | Mushuc Runa | - | Deportivo Cuenca | 3:2 | ||||
| 17. Jornada | 05.11.2016 | Delfín SC | - | Mushuc Runa | 2:1 | ||||
| 18. Jornada | 12.11.2016 | El Nacional | - | Mushuc Runa | 2:1 | ||||
| 19. Jornada | 20.11.2016 | Mushuc Runa | - | Aucas | 2:0 | ||||
| 20. Jornada | 27.11.2016 | Deportivo Cuenca | - | Mushuc Runa | 3:1 |  |
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| 21. Jornada | 04.12.2016 | Mushuc Runa | - | Barcelona | 2:4 | ||||
| 22. Jornada | 10.12.2016 | LDU Quito | - | Mushuc Runa | 1:2 |
Ecuador