| 11. Jornada | 11.12.1999 | PS Kalamata | - | Apollon Smyrnis | 1:1 | ||||
| 20. Jornada | 20.02.2000 | Olympiacos | - | Apollon Smyrnis | 2:0 | ||||
| 22. Jornada | 05.03.2000 | Aris Saloniki | - | Apollon Smyrnis | 2:1 |  |
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| 25. Jornada | 26.03.2000 | Apollon Smyrnis | - | Panachaiki GE | 0:0 | ||||
| 26. Jornada | 02.04.2000 | AO Proodeftiki | - | Apollon Smyrnis | 2:0 | ||||
| 27. Jornada | 12.04.2000 | Apollon Smyrnis | - | Panionios GSS | 2:1 | ||||
| 28. Jornada | 16.04.2000 | Apollon Smyrnis | - | PS Kalamata | 1:2 | ||||
| 29. Jornada | 23.04.2000 | AO Kavala | - | Apollon Smyrnis | 1:3 | ||||
| 30. Jornada | 03.05.2000 | Apollon Smyrnis | - | AO Trikala | 5:2 | ||||
| 33. Jornada | 21.05.2000 | Panathinaikos | - | Apollon Smyrnis | 5:0 | |
Grecia