| 4. Jornada | 20.09.1998 | Ionikos Nikea | - | AO Kavala | 4:2 | ||||
| 5. Jornada | 26.09.1998 | Panathinaikos | - | Ionikos Nikea | 2:1 | ||||
| 6. Jornada | 04.10.1998 | Ionikos Nikea | - | Ethnikos Piraeus | 5:0 |  |
|||
| 7. Jornada | 25.10.1998 | Iraklis Saloniki | - | Ionikos Nikea | 2:1 | ||||
| 8. Jornada | 01.11.1998 | Ionikos Nikea | - | Skoda Xanthi | 0:1 | ||||
| 13. Jornada | 13.12.1998 | Ionikos Nikea | - | Veria FC | 1:0 | ||||
| 14. Jornada | 20.12.1998 | OFI Heraklion | - | Ionikos Nikea | 2:1 | ||||
| 15. Jornada | 16.01.1999 | Ionikos Nikea | - | Paniliakos Pyrgos | 1:1 |  |
|||
| 17. Jornada | 30.01.1999 | Ionikos Nikea | - | Ethnikos Asteras | 5:0 | ||||
| 21. Jornada | 28.02.1999 | AO Kavala | - | Ionikos Nikea | 1:3 | ||||
| 24. Jornada | 21.03.1999 | Ionikos Nikea | - | Iraklis Saloniki | 0:2 | ||||
| 28. Jornada | 02.05.1999 | Apollon Smyrnis | - | Ionikos Nikea | 1:1 | ||||
| 29. Jornada | 09.05.1999 | Ionikos Nikea | - | Panelefsiniakos Elefsinas | 3:0 | ||||
| 30. Jornada | 12.05.1999 | Veria FC | - | Ionikos Nikea | 0:2 | ||||
| 32. Jornada | 19.05.1999 | Paniliakos Pyrgos | - | Ionikos Nikea | 1:4 | ||||
| 33. Jornada | 23.05.1999 | Ionikos Nikea | - | AO Proodeftiki | 2:0 |
Grecia