| 3. Jornada | 19.08.2006 | Jaguares Chiapas | - | Pumas UNAM | 0:1 | ||||
| 4. Jornada | 27.08.2006 | UAG Tecos | - | Jaguares Chiapas | 2:3 |  |
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| 5. Jornada | 31.08.2006 | Jaguares Chiapas | - | CF América | 2:0 | ||||
| 6. Jornada | 03.09.2006 | Monarcas Morelia | - | Jaguares Chiapas | 2:1 | ||||
| 7. Jornada | 09.09.2006 | Jaguares Chiapas | - | Club San Luis | 1:1 |  |
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| 8. Jornada | 14.09.2006 | UANL Tigres | - | Jaguares Chiapas | 1:1 | |
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| 9. Jornada | 16.09.2006 | Jaguares Chiapas | - | Atlas Guadalajara | 4:0 |  |
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| 11. Jornada | 01.10.2006 | Atlante | - | Jaguares Chiapas | 0:1 | ||||
| 12. Jornada | 07.10.2006 | Jaguares Chiapas | - | Deportivo Toluca | 1:1 | |
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| 13. Jornada | 15.10.2006 | Santos Laguna | - | Jaguares Chiapas | 0:0 | |
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| 14. Jornada | 22.10.2006 | Jaguares Chiapas | - | CF Pachuca | 0:1 | ||||
| 15. Jornada | 29.10.2006 | Cruz Azul | - | Jaguares Chiapas | 1:0 | ||||
| 16. Jornada | 04.11.2006 | Jaguares Chiapas | - | CF Monterrey | 1:1 | |
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