| 1. Jornada | 23.09.2023 | Makedonikos FC | - | AEP Iraklis FC | 0:0 | ||||
| 2. Jornada | 01.10.2023 | AEP Iraklis FC | - | Anagennisi Karditsa | 1:1 | ||||
| 3. Jornada | 11.10.2023 | AE Lárissa | - | AEP Iraklis FC | 1:0 | ||||
| 4. Jornada | 25.10.2023 | AEP Iraklis FC | - | PAOK Saloniki II | 2:0 | ||||
| 7. Jornada | 04.11.2023 | AEP Iraklis FC | - | Levadiakos | 0:1 | ||||
| 8. Jornada | 12.11.2023 | Niki Volou FC | - | AEP Iraklis FC | 3:1 | ||||
| 9. Jornada | 15.11.2023 | AEP Iraklis FC | - | Apollon Pontou | 0:1 | ||||
| 10. Jornada | 19.11.2023 | Kampaniakos FC | - | AEP Iraklis FC | 1:3 | ||||
| 11. Jornada | 25.11.2023 | AEP Iraklis FC | - | AEK Athen II | 1:0 | ||||
| 12. Jornada | 03.12.2023 | AEP Iraklis FC | - | Kozani FC | 1:1 | ||||
| 13. Jornada | 10.12.2023 | Aiolikos Mytilinis | - | AEP Iraklis FC | 1:1 | ||||
| 14. Jornada | 18.12.2023 | AEP Iraklis FC | - | Makedonikos FC | 5:1 | ||||
| 15. Jornada | 03.01.2024 | Anagennisi Karditsa | - | AEP Iraklis FC | 2:1 | ||||
| 16. Jornada | 07.01.2024 | AEP Iraklis FC | - | AE Lárissa | 1:1 | ||||
| 17. Jornada | 15.01.2024 | PAOK Saloniki II | - | AEP Iraklis FC | 1:1 |  |
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