| 1. Jornada | 17.07.2016 | NK Maribor | - | FC Koper | 1:0 | ||||
| 2. Jornada | 23.07.2016 | FC Koper | - | NK Aluminij | 1:0 |  |
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| 3. Jornada | 30.07.2016 | Rudar Velenje | - | FC Koper | 2:0 | ||||
| 4. Jornada | 06.08.2016 | FC Koper | - | NK Celje | 2:1 |  |
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| 5. Jornada | 13.08.2016 | NK Domžale | - | FC Koper | 2:0 | ||||
| 6. Jornada | 20.08.2016 | FC Koper | - | NK Radomlje | 3:0 | ||||
| 8. Jornada | 10.09.2016 | FC Koper | - | NK Krško | 1:0 | ||||
| 9. Jornada | 28.09.2016 | ND Gorica | - | FC Koper | 1:1 | |
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| 12. Jornada | 01.10.2016 | FC Koper | - | Rudar Velenje | 1:4 | ||||
| 13. Jornada | 16.10.2016 | NK Celje | - | FC Koper | 1:1 | ||||
| 15. Jornada | 30.10.2016 | NK Radomlje | - | FC Koper | 1:3 | ||||
| 16. Jornada | 06.11.2016 | FC Koper | - | Olimpija Ljubljana | 1:2 | ||||
| 18. Jornada | 26.11.2016 | FC Koper | - | ND Gorica | 0:0 |
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