| 6. Jornada | 10.09.2006 | Viktoria Plzeň | - | Sigma Olomouc | 2:0 |  |
|||
| 7. Jornada | 17.09.2006 | Sigma Olomouc | - | 1. FC Brno | 1:0 | ||||
| 8. Jornada | 24.09.2006 | SK Kladno | - | Sigma Olomouc | 3:2 | ||||
| 9. Jornada | 01.10.2006 | Sigma Olomouc | - | 1. FC Slovácko | 2:1 | ||||
| 10. Jornada | 16.10.2006 | FK Jablonec 97 | - | Sigma Olomouc | 2:0 |  |
|||
| 11. Jornada | 22.10.2006 | Sigma Olomouc | - | FK SIAD Most | 2:0 | ||||
| 12. Jornada | 29.10.2006 | FK Marila Příbram | - | Sigma Olomouc | 1:1 | |
|||
| 13. Jornada | 05.11.2006 | Sigma Olomouc | - | FK Teplice | 1:1 | |
|||
| 15. Jornada | 19.11.2006 | Sigma Olomouc | - | Tescoma Zlín | 3:0 | ||||
| 16. Jornada | 26.11.2006 | Dynamo České Budějovice | - | Sigma Olomouc | 2:0 | ||||
| 17. Jornada | 03.12.2006 | Sigma Olomouc | - | FK Mladá Boleslav | 3:1 | |
República Checa