| 12. Jornada | 14.09.2016 | Deportes Tolima | - | Cortuluá | 0:2 |  |
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| 13. Jornada | 18.09.2016 | Cortuluá | - | Fortaleza FC | 2:2 | ||||
| 14. Jornada | 25.09.2016 | Atlético Nacional | - | Cortuluá | 1:1 | ||||
| 16. Jornada | 15.10.2016 | Boyacá Chicó | - | Cortuluá | 3:1 | |
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| 17. Jornada | 24.10.2016 | Cortuluá | - | Millonarios | 2:3 | ||||
| 18. Jornada | 29.10.2016 | Atlético Bucaramanga | - | Cortuluá | 3:1 | ||||
| 19. Jornada | 06.11.2016 | Cortuluá | - | Atlético Junior | 1:2 | ||||
| 20. Jornada | 21.11.2016 | Envigado FC | - | Cortuluá | 1:0 |
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